Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Psme1P97371 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme1P97371 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme1P97371 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psme1P97371 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psme1P97371 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme1P97371 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme1P97371 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psme1P97371 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Psme1P97371 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme1P97371 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psme1P97371 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme1P97371 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme1P97371 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psme1P97371 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Psme1P97371 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms