Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh10P70408 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh10P70408 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh10P70408 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh10P70408 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh10P70408 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdh10P70408 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdh10P70408 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdh10P70408 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh10P70408 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms