Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux2P70298 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cux2P70298 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cux2P70298 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux2P70298 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cux2P70298 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cux2P70298 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux2P70298 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux2P70298 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux2P70298 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux2P70298 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cux2P70298 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cux2P70298 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux2P70298 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux2P70298 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms