Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd13P70217 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Hoxd13P70217 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd13P70217 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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