Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap25P60879 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snap25P60879 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms