Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fgd1P52734 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgd1P52734 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms