Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf1P46099 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf1P46099 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Klf1P46099 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Klf1P46099 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183 ms