Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NodalP43021 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NodalP43021 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NodalP43021 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NodalP43021 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NodalP43021 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NodalP43021 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NodalP43021 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NodalP43021 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NodalP43021 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NodalP43021 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NodalP43021 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NodalP43021 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NodalP43021 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NodalP43021 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NodalP43021 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NodalP43021 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NodalP43021 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NodalP43021 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NodalP43021 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NodalP43021 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NodalP43021 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NodalP43021 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NodalP43021 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NodalP43021 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms