Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab21P35282 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rab21P35282 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab21P35282 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab21P35282 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms