Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Cnga1P29974 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cnga1P29974 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cnga1P29974 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnga1P29974 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms