Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept4P28661 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sept4P28661 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept4P28661 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept4P28661 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept4P28661 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept4P28661 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept4P28661 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept4P28661 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms