Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc6a9P28571 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc6a9P28571 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms