Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3P21107 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms