Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxb9P20615 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb9P20615 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms