Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phka1P18826 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phka1P18826 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phka1P18826 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phka1P18826 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phka1P18826 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phka1P18826 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Phka1P18826 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phka1P18826 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms