Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Spi1P17433 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spi1P17433 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 392.8 ms