Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh3P13705 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msh3P13705 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh3P13705 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msh3P13705 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msh3P13705 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms