Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chrm1P12657 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrm1P12657 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms