Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lamc1P02468 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Lamc1P02468 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamc1P02468 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms