Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna2P01573 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna2P01573 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna2P01573 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258 ms