Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx8O88983 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx8O88983 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx8O88983 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx8O88983 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx8O88983 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx8O88983 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms