Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3aO88508 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3aO88508 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3aO88508 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms