Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja1O55176 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pja1O55176 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja1O55176 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pja1O55176 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja1O55176 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pja1O55176 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms