Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
StrnO55106 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
StrnO55106 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StrnO55106 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StrnO55106 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StrnO55106 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StrnO55106 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StrnO55106 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
StrnO55106 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
StrnO55106 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StrnO55106 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StrnO55106 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StrnO55106 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
StrnO55106 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StrnO55106 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
StrnO55106 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
StrnO55106 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StrnO55106 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StrnO55106 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StrnO55106 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StrnO55106 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
StrnO55106 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StrnO55106 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
StrnO55106 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
StrnO55106 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
StrnO55106 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
StrnO55106 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StrnO55106 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StrnO55106 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StrnO55106 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
StrnO55106 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StrnO55106 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StrnO55106 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StrnO55106 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StrnO55106 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StrnO55106 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
StrnO55106 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StrnO55106 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
StrnO55106 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StrnO55106 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StrnO55106 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StrnO55106 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms