Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f6O54917 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f6O54917 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2f6O54917 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2f6O54917 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2f6O54917 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms