Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb3O35393 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb3O35393 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms