Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smad7O35253 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Smad7O35253 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Smad7O35253 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad7O35253 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad7O35253 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad7O35253 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Smad7O35253 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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