Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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Nedd9O35177 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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Nedd9O35177 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Nedd9O35177 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Nedd9O35177 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Nedd9O35177 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Nedd9O35177 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nedd9O35177 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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