Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcns1O35173 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Kcns1O35173 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Kcns1O35173 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcns1O35173 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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