Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckarO08786 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckarO08786 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckarO08786 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckarO08786 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckarO08786 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckarO08786 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckarO08786 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckarO08786 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckarO08786 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckarO08786 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckarO08786 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CckarO08786 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CckarO08786 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CckarO08786 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckarO08786 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CckarO08786 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckarO08786 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckarO08786 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckarO08786 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CckarO08786 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckarO08786 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckarO08786 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckarO08786 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckarO08786 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckarO08786 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms