Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Efna3O08545 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efna3O08545 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms