Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vwa3bJ9JI28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa3bJ9JI28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa3bJ9JI28 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms