Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calhm3J3QMI4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calhm3J3QMI4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Calhm3J3QMI4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms