Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms