Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20828J3KMI7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Gm20828J3KMI7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20828J3KMI7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Gm20828J3KMI7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20828J3KMI7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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