Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r238E9Q373 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r238E9Q373 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms