Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms