Protein–RNA interactions for Protein: E9PV26

Prr36, Proline-rich 36, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr36E9PV26 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr36E9PV26 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr36E9PV26 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms