Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn7aB1AYL1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn7aB1AYL1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms