Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hacd4A2AKM2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hacd4A2AKM2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms