Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SQF0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1L1SQF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1L1SQF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1L1SQF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms