Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms