Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1520401A03RikA0A0J9YVH6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.2 ms