Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5U7

Ighv1-22, Immunoglobulin heavy variable 1-22 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-22A0A075B5U7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv1-22A0A075B5U7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv1-22A0A075B5U7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-22A0A075B5U7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms