Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tsc22d3Q9Z2S7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms