Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knop1Q9Z2Q2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knop1Q9Z2Q2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9323.8 ms