Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Carm1Q9WVG6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Carm1Q9WVG6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Carm1Q9WVG6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Carm1Q9WVG6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Carm1Q9WVG6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Carm1Q9WVG6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Carm1Q9WVG6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms