Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Stub1Q9WUD1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms