Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh13Q9WTR5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh13Q9WTR5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh13Q9WTR5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 703.3 ms