Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb1bp2Q9R000 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb1bp2Q9R000 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb1bp2Q9R000 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itgb1bp2Q9R000 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itgb1bp2Q9R000 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms